L’étape suivante de la sélection par mutation est de déterminer les plantes qui ont effectivement acquis les nouveaux caractères souhaités. Grâce aux avancées récentes dans le domaine des technologies de détection, l’AIEA aide les États Membres à tester les plantes plus efficacement et à accélérer la mise au point de lignées mutantes à commercialiser.
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Détection des mutations
La détection de mutations induites innovantes est depuis longtemps un défi de taille. Les événements de mutation sont si rares qu’il faut créer de très grandes populations de variétés mutantes pour détecter les mutations utiles. La production, la manipulation et l’analyse des populations de variétés mutantes comptant souvent des milliers et des milliers d’individus est une entreprise titanesque. On considère souvent que l’« art » véritable de la sélection par mutation consiste à déterminer et à sélectionner, parmi les nombreuses plantes ayant subi une mutation, les rares cas où un nouveau caractère recherché a été acquis à la suite de la mutation.
En collaboration avec la FAO, l’AIEA renforce la capacité des États Membres à améliorer l’efficacité des méthodes de criblage requises et ainsi accélérer la transformation de nouvelles lignées mutantes de cultures en variétés commerciales pouvant être utilisées par les paysans.
Le processus d’identification et de sélection des plantes mutantes ayant des caractères améliorés comprend deux étapes principales, à savoir le criblage et la confirmation (aussi appelée validation) des mutants. Depuis les débuts de la domestication des plantes, leur sélection sur la base de caractères visibles (phénotypes) a été la méthode la plus couramment utilisée dans le domaine de l’amélioration des plantes pour sélectionner des cultures améliorées. Les protocoles de sélection, comme ceux visant à déterminer par exemple la résistance à la salinité en milieu hydroponique (une méthode de culture des plantes utilisant des solutions minérales hors sol), les méthodes de détermination de la résistance à la sécheresse et les protocoles de dépistage des maladies sont des méthodes efficaces de détection de phénotypes mutants.
Un outil de ce genre est le criblage de génotypes, qui permet de déterminer les différences existant dans le patrimoine génétique (génotype) de plantes individuelles en examinant la séquence ADN d’un individu au moyen de dosages biologiques (un type d’expérience scientifique) et en la comparant à celle d’un autre individu ou à une séquence de référence. Cet outil permet de déterminer une variation liée à un caractère intéressant ou héritée avec celui‑ci.
Les avancées récentes dans le domaine des technologies de détection à haut débit de la mutation, comme le séquençage du génome complet, ont permis de déterminer plus efficacement les modifications de l’ADN qui se traduisent par un nouveau caractère. Ainsi, des marqueurs moléculaires pourraient être mis au point pour aider les généticiens à accélérer le processus d’introduction du caractère recherché dans d’autres variétés commerciales. D’autres méthodes de sélection à haut débit efficaces permettant de déterminer des délétions induites d’ADN sont les techniques de génétique inverse telles que le TILLING (ciblage de lésions locales dans les génomes), qui permet l’identification ciblée de mutations dans un gène spécifique.
