Ящур — это высококонтагиозная болезнь, встречающаяся у парнокопытных животных, таких как коровы, свиньи и козы. Она может быстро распространяться среди домашнего скота, приводя, таким образом, к нарушению региональной и международной торговли животными и продуктами животного происхождения. Эта болезнь характеризуется повышением температуры и появлением язв в области копыт и в ротовой полости, на языке и губах. В начале этого года вирусологическая лаборатория в Тунисе получила мазки из ротовой полости коров, которые предположительно могли быть заражены ящуром.
Ранее, в январе этого года, вспышка ящура произошла в Казахстане. Это привело к временным ограничениям на экспорт животных и животноводческой продукции в некоторые страны, которые были введены в качестве меры предосторожности.
Вспышки подобных болезней среди домашнего скота могут дестабилизировать местную экономику. Для сравнения, по оценкам Продовольственной и сельскохозяйственной организации Объединенных Наций (ФАО), вспышка другой высококонтагиозной болезни животных — нодулярного дерматита — на Балканах в 2016 и 2017 годах обошлась пострадавшим странам более чем в 20 млн евро. Изначально обнаруженная в Северной Африке, эта болезнь распространилась вплоть до России и Южной Азии. Именно поэтому, когда возникло подозрение на вспышку ящура в Тунисе, эксперты знали, что нужно действовать быстро.
Через несколько дней после передачи проб в лабораторию геномного секвенирования Суфьян Сегайе, вирусолог из лаборатории Института ветеринарных исследований Туниса, получил результаты, которые подтвердили наличие у коров штамма ящура. Он уведомил ветеринарный контроль о необходимости введения мер для предотвращения распространения болезни. Своевременное подтверждение результатов было обеспечено благодаря партнерской работе МАГАТЭ и ФАО, предусматривающей услуги по секвенированию и обучение персонала, необходимое для обработки результатов.
«Мы получили результаты секвенирования по подозрению на ящур очень быстро. Пробы были отправлены в лабораторию в Берлине в пятницу, а результаты секвенирования мы получили уже в понедельник днем, — поясняет Cегайе. — Это позволило нам провести анализ для идентификации конкретного штамма ящура в рекордно короткие сроки — менее чем через неделю после получения проб. Во вторник мы отправили отчет об обнаружении штамма ящура в ветеринарный контроль». Штамм ящура необходимо идентифицировать, чтобы подобрать или разработать наиболее эффективную вакцину.
Генетическое секвенирование необходимо для определения того, является ли распространяющаяся болезнь эндемичной (характерной для определенной местности) или занесенной из другого региона. «Генетическое секвенирование помогает понять, к какому кластеру принадлежит патоген — то есть биологический агент, вызывающий болезнь, и какая вакцина наиболее эффективна против этого патогена, — подчеркивает Иванчо Налетоски, специалист по ветеринарии в Совместном центре ФАО/МАГАТЭ по ядерным методам в области продовольствия и сельского хозяйства. — Секвенирование также важно для определения закономерностей в мутации патогенов». На основе генетического секвенирования можно составить филогенетическое дерево, которое отображает родословную вида.
«С помощью филогенетического анализа мы определили, что у нас уже есть вакцина, которая способна защитить наш скот от этой болезни. Ветеринарные службы провели перифокальную вакцинацию, чтобы снизить риск распространения ящура», — сообщает Cегайе. Перифокальная вакцинация, или буферная вакцинация, проводится в зоне вокруг очага заболевания, чтобы предотвратить распространение вируса в соседние регионы.
